Tổ chức chung

Từ năm 2006 thực hiện chế độ Chính ủy, Chính trị viên trong Quân đội.[4] Tổ chức Đảng bộ trong Quân đoàn 3 theo phân cấp như sau:

• Đảng bộ Quân đoàn 3 là cao nhất.
• Đảng bộ Bộ Tham mưu, Cục Chính trị, Cục Hậu cần, Cục Kỹ thuật, các Sư đoàn, Lữ đoàn và các đơn vị tương đương khác.
• Đảng bộ các đơn vị cơ sở trực thuộc các Cục, Sư đoàn (tương đương cấp Tiểu đoàn và Trung đoàn)
• Chi bộ các cơ quan đơn vị trực thuộc các đơn vị cơ sở (tương đương cấp Đại đội)

Thành phần

Về thành phần của Đảng ủy Quân đoàn 3 thường bao gồm như sau:

1. Bí thư: Chính ủy Quân đoàn 3
2. Phó Bí thư: Tư lệnh Quân đoàn 3

Ban Thường vụ

1. Ủy viên Thường vụ: Phó Tư lệnh kiêm Tham mưu trưởng
2. Ủy viên Thường vụ: Phó Chính ủy Quân đoàn
3. Ủy viên Thường vụ: Chủ nhiệm chính trị Quân đoàn

Ban Chấp hành Đảng bộ

1. Đảng ủy viên: Phó Tư lệnh
2. Đảng ủy viên: Phó Tham mưu trưởng
3. Đảng ủy viên: Cục trưởng Cục Hậu cần
4. Đảng ủy viên: Cục trưởng Cục Kỹ thuật
5. Đảng ủy viên: Phó Chủ nhiệm UBKT ĐUQĐ
6. Đảng ủy viên: Phó Chủ nhiệm chính trị
7. Đảng ủy viên: Chính ủy Sư đoàn 10
8. Đảng ủy viên: Chính ủy Sư đoàn 320
9. Đảng ủy viên: Sư đoàn trưởng Sư đoàn 31
10. Đảng ủy viên: Hiệu trưởng Trường Quân sự
11. Đảng ủy viên: Lữ đoàn trưởng
12. Đảng ủy viên: Lữ đoàn trưởng